DNA探针技术主要指的是，利用特异性的DNA探针对水质大肠杆菌当中的核糖体，即RNA进行相应的检测。就目前而言，DNA探针技术主要被应用到了临床医学以及食品中大肠杆菌的检测中，在实际的应用过程当中，用于对大肠杆菌进行检测的核酸探针有着很多种类型，其中利用的靶基因大多是能够产生毒素的基因，例如VT、eaeA等，在检测的过程中绝大多数时候使用的是生物素以及荧光素等非放射性的物质对大肠杆菌进行标记，而荧光探针以及寡核苷酸探针已经逐渐被应用到了水质大肠杆菌的检测过程当中，并取得了十分突出的成效，这一类生物探针技术在应用中由于具备检测精度较高，再加上检测时间较短的优势，能够更为快速地对水质环境当中的大肠杆菌进行检测，而且在实际检测中DNA探针都会和PCR技术实现有机结合，促进大肠杆菌检测效率的提升。