传统微生物菌群分析方法建立在微生物分离、纯种培养的基础上，通过对纯种微生物进行显微观察和生理生化特性研究来认识环境中菌群多样性是目前国内常见的研究方法。如叶可萍等采用传统微生物菌群分析方法研究了酱卤鸭翅贮藏过程中的菌群结构。本试验结果表明，采用传统分离微生物的方法从卤鸭掌中分离纯化出5 株菌落形态特征典型的菌株，经过革兰氏染色镜检，同时结合微生物鉴定图谱以及生理生化鉴定方法，确定从卤鸭掌中分离出的菌株为:乳酸菌、葡萄球菌和假单胞菌属。采用传统微生物菌群分析方法发现，不同部位冷鲜鸭制品菌群主要由假单胞菌、肠杆菌、乳酸菌组成，这与本试验中常规分离鉴定结果基本一致。

在对卤鸭掌优势腐败菌鉴定时，采用传统方法鉴定出乳酸菌、葡萄球菌和假单胞菌属，而16S rDNA 菌群分析法中未分析出乳酸菌; 16S rDNA 菌群分析法鉴定出了不动细菌属、放线菌属、金黄杆菌属、贪铜菌属、栖水菌属、埃希氏菌属、小球菌属、消化球菌属、Phascolarctobacterium、丙酸杆菌属和寡养单胞菌属，而传统方法未分离出以上微生物，2 种方法鉴定结果有差异，但卤鸭掌中主要的优势腐败菌都能够通过以上2 种方法分离鉴定。优势腐败菌菌相的确定为延长卤鸭掌货架期提供了研究基础。